这是黄金家族内部又一次你死我活的兄弟相残。蒙哥死后,拖雷的四个儿子中的幼子阿里不哥正好留镇漠北。他抓住了这个机会,立即与蒙古各地封王与显贵取 得了联系,以蒙古幼子守业的传统为理由,要求召开忽里台大会。阿里不哥很清楚,对他的汗位构成直接威胁的就是他的哥哥,因此他选中在蒙古的本土哈剌 和林召开大会,这样就可以迫使忽必烈离开他的势力范围,逼迫他就范了。

  这个时候忽必烈正在率领蒙古的精锐部队在南宋的鄂州地区作战。 很明显,忽必烈最初并没有打算撤军,他打算先占领南宋,以此为自己取得汗位增添更为有力的砝码。当他接到蒙哥的死讯时,他的部将劝他回师,而忽必烈的回答 是:“今已渡江,是言何益!”不过很快他就接到了留守在后方的妻子察必的通知,了解到了阿里不哥的阴谋,这样一来,他就必须返回了。

  1260年初,忽必烈与草草地签订了一份和约,留下一小股部队,就匆匆返回开平。不过这份和约被奸相隐瞒了,他扣留了蒙古使节,出兵歼灭了留守的那一小股蒙古部队,并谎称大捷,以致错误地引导了南宋对蒙古的态度。

   忽必烈清楚地意识到,阿里不哥鞭长莫及,他无法阻止自己有效地调动和控制进入汉地的蒙军及汉军。有了这一资本,忽必烈不肯轻易离开经营有年的中原而贸然 北上。双方间使臣往返,交涉不断,不见任何成效,而矛盾却日趋激化。1260年4月中,忽必烈拘禁了阿里不哥派往燕京的心腹脱里赤,,在新筑成不 久的开平城首先召开忽里台大会,宣布即大汗位。

  忽必烈在漠南的抢先即位,完全打乱了阿里不哥的预谋。无奈之下,阿里不哥只得匆匆于 1260年夏季,在驻地阿勒泰山中,召集留守漠北封地的诸王宗戚,举行大会,并在会上被拥立为大汗。这样就出现了南北两大汗相互抗衡的局面。在这次较量 中,无论是忽必烈还是阿里不哥,都得到了相当部分的蒙古显贵的拥戴。忽必烈得到东道诸王的支持较多,而阿里不哥则得到了西道诸王的支持。尽管从表面上看, 旭烈兀和钦察汗国的态度中立,不无暧昧之处,然而替旭烈兀留守漠北封地的儿子药木忽儿,最初是支持阿里不哥的。而钦察汗国的钱币上更刻有阿里不哥的名字, 更表明了钦察汗国的立场。这样一来,最后谁能问鼎,就要靠各自的能力了。

  为了能够顺利取得胜利,忽必烈做了一系列重要举措。在忽必烈宣布为汗的次月,他向天下颁行了《即位诏》,在诏书中忽必烈明确宣布:“祖述变通,正在今日。”这就意味着他向中原的儒士们发出信号,要采用汉制。这样一来,忽必烈就有了一个相对稳定的后方。

   与此同时,忽必烈毫不迟疑地开始着手征调和组编忠于他个人的精锐部队。由于蒙哥的怯薛大军在扶柩北归后大都滞留在漠北,归入了阿里不哥旗下,忽必烈就在 潜邸宿卫的基础上迅速扩充,重建了一支大汗的怯薛部队,以戍守北方各地,尤其是燕京、开平一线心腹地区。另外,他还多次征集各地兵员,很快组建起一支拱卫 京畿的侍卫亲军。统领侍卫亲军的,是随他出生入死的亲信董文炳等将领。解决了防卫问题后,忽必烈开始着手对付阿里不哥。他下令“诸路市马万匹送开平府”, “诏燕京、西京、北京三路宣抚司运米十万石”至漠南沿线,这样很快完成了扼守大漠南缘、伺机渡漠远征的战前部署。并且为了集中力量对付阿里不哥,忽必烈对 南宋的背约行为也采取克制的态度。他在蒙宋交界线上的江淮和江汉两地,分别派李和史权镇守,只在防卫,并不攻宋。

  1260年秋,阿 里不哥兵分两路,大举南下。东路军由药木忽儿、王合剌察儿统率,从和林逾漠南进。西路军由阿兰答儿统领,直指六盘山,接应从四川前线退屯到该地的蒙哥攻宋 主力。阿里不哥的左路军直逼忽必烈的腹地燕京。忽必烈亲自领军主动出击,成功地击溃了药木忽儿和王合剌察儿,造成了阿里不哥难以继续立足和林的局面。阿里 不哥被迫退到了由他继承的拖雷封地吉里吉思,忽必烈则顺利地进至和林。

  阿里不哥南下六盘山的西路军虽是偏师,但它牵动川蜀关陕。开 始,忽必烈的守将廉希宪命秦巩世侯汪家的军队拒阻浑都海,做疑兵,“但张声势,使不得东”。浑都海中计,采取了“重装北归,以应和林”的下策。恰巧在北归 途中与阿兰答儿会师。于是浑都海又重新折返东向,并派人约结陇蜀诸将,忽必烈派驻镇守的部队军心大乱,纷纷退守兴元。就在这危急时候,忽必烈的增援部队到 达,最后击败了阿里不哥的部队。俘虏并处死了阿兰答儿和浑都海。这样,往日蒙古大军所占领的中原地区就真正归属于忽必烈统辖了。

  阿里 不哥在吉里吉思经过休整,到1261年的秋天,元气稍有恢复,便又举兵东来。这一次,应该说是一次偷袭。他事先遣使者对忽必烈留守的将领移相哥伪称率众归 降,使移相哥信以为真,果然疏于防备,结果突袭成功。移相哥大军溃散,和林城再次失守。10月,忽必烈率军再度北征。这次双方在昔木土脑儿之西展开大战, 阿里不哥被击败。但是不知道是出于什么原因,忽必烈并没有追击阿里不哥就撤退了。阿里不哥听说忽必烈撤退,这时正好阿速台率领的后继部队赶到,于是阿里不 哥回军再战。这一次双方不分胜负,激战到深夜,最后各自引军后退。这一年冬末,忽必烈回师,形势似乎缓和下来。